Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
1810065E05RikQ5NC41 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms