Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr39u1Q5M8N4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr39u1Q5M8N4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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