Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps41Q5KU39 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms