Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st6Q5GFD5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hs3st6Q5GFD5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hs3st6Q5GFD5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hs3st6Q5GFD5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hs3st6Q5GFD5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hs3st6Q5GFD5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hs3st6Q5GFD5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hs3st6Q5GFD5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hs3st6Q5GFD5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hs3st6Q5GFD5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms