Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm3Q5F4S9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trpm3Q5F4S9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms