Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q5EBG8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q5EBG8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q5EBG8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q5EBG8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q5EBG8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q5EBG8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q5EBG8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q5EBG8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q5EBG8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q5EBG8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q5EBG8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q5EBG8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms