Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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