Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp22Q5DU02 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms