Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Scn2bQ56A07 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Scn2bQ56A07 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Scn2bQ56A07 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Scn2bQ56A07 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Scn2bQ56A07 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Scn2bQ56A07 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Scn2bQ56A07 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scn2bQ56A07 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Scn2bQ56A07 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Scn2bQ56A07 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Scn2bQ56A07 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Scn2bQ56A07 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Scn2bQ56A07 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Scn2bQ56A07 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Scn2bQ56A07 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn2bQ56A07 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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