Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prune2Q52KR3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prune2Q52KR3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms