Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccnl1Q52KE7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms