Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Shank3Q4ACU6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Shank3Q4ACU6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms