Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1nQ497L1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms