Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms