Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ckap2Q3V1H1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms