Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc43Q3V0L5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc43Q3V0L5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms