Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc9Q3V038 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ttc9Q3V038 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc9Q3V038 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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