Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc160Q3UYG1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms