Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pate2Q3UW31 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pate2Q3UW31 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pate2Q3UW31 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pate2Q3UW31 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pate2Q3UW31 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pate2Q3UW31 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pate2Q3UW31 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pate2Q3UW31 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pate2Q3UW31 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pate2Q3UW31 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pate2Q3UW31 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pate2Q3UW31 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms