Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2-Eb2Q3UUV9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms