Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms