Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ8

Cdkl5, Cyclin-dependent kinase-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl5Q3UTQ8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkl5Q3UTQ8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkl5Q3UTQ8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms