Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms