Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Elf3Q3UPW2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Elf3Q3UPW2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Elf3Q3UPW2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Elf3Q3UPW2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Elf3Q3UPW2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Elf3Q3UPW2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Elf3Q3UPW2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Elf3Q3UPW2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Elf3Q3UPW2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Elf3Q3UPW2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Elf3Q3UPW2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Elf3Q3UPW2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Elf3Q3UPW2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Elf3Q3UPW2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.5 ms