Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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D13Ertd608eQ3UPR8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms