Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3UPC7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q3UPC7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3UPC7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3UPC7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3UPC7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3UPC7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms