Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULF4

Spg7, Paraplegin, mousemouse

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7Q3ULF4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spg7Q3ULF4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spg7Q3ULF4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms