Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam83fQ3UKU4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam83fQ3UKU4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam83fQ3UKU4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam83fQ3UKU4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam83fQ3UKU4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam83fQ3UKU4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam83fQ3UKU4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fam83fQ3UKU4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms