Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms