Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp19Q3UJD6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms