Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc34Q3UI66 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc34Q3UI66 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc34Q3UI66 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms