Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Greb1Q3UHK3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms