Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zswim8Q3UHH1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zswim8Q3UHH1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms