Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef1Q3UHC1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef1Q3UHC1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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