Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph3aQ3UFY4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms