Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Puf60Q3UEB3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms