Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trafd1Q3UDK1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms