Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp8Q3UD82 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp8Q3UD82 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms