Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atxn7l3bQ3UD01 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms