Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem109Q3UBX0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms