Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pid1Q3UBG2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pid1Q3UBG2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pid1Q3UBG2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pid1Q3UBG2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pid1Q3UBG2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pid1Q3UBG2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 255.3 ms