Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0I6

Smim6, MCG148180, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim6Q3U0I6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim6Q3U0I6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms