Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trmt1Q3TX08 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms