Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3TTJ4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3TTJ4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms