Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
D17Wsu92eQ3TT38 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
D17Wsu92eQ3TT38 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D17Wsu92eQ3TT38 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms