Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS87

9130409I23Rik, MCG19844, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130409I23RikQ3TS87 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
9130409I23RikQ3TS87 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
9130409I23RikQ3TS87 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
9130409I23RikQ3TS87 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
9130409I23RikQ3TS87 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
9130409I23RikQ3TS87 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
9130409I23RikQ3TS87 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms