Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fubp3Q3TIX6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fubp3Q3TIX6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fubp3Q3TIX6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms