Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Jmjd8Q3TA59 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Jmjd8Q3TA59 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Jmjd8Q3TA59 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms