Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr27Q3SYJ2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms