Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hddc2Q3SXD3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc2Q3SXD3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms